Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG3Q96JB2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms