Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TPD52L3Q96J77 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TPD52L3Q96J77 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms