Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL1Q96FI4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms