Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms