Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC59Q96AG4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC59Q96AG4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms