Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HLA-CQ95604 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms