Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP9XQ93008 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms