Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms