Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CSRNP3Q8WYN3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CSRNP3Q8WYN3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CSRNP3Q8WYN3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CSRNP3Q8WYN3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CSRNP3Q8WYN3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CSRNP3Q8WYN3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CSRNP3Q8WYN3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CSRNP3Q8WYN3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CSRNP3Q8WYN3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CSRNP3Q8WYN3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CSRNP3Q8WYN3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CSRNP3Q8WYN3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CSRNP3Q8WYN3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CSRNP3Q8WYN3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CSRNP3Q8WYN3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CSRNP3Q8WYN3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CSRNP3Q8WYN3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CSRNP3Q8WYN3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CSRNP3Q8WYN3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CSRNP3Q8WYN3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CSRNP3Q8WYN3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CSRNP3Q8WYN3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CSRNP3Q8WYN3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CSRNP3Q8WYN3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CSRNP3Q8WYN3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CSRNP3Q8WYN3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CSRNP3Q8WYN3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CSRNP3Q8WYN3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CSRNP3Q8WYN3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CSRNP3Q8WYN3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CSRNP3Q8WYN3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CSRNP3Q8WYN3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CSRNP3Q8WYN3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CSRNP3Q8WYN3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CSRNP3Q8WYN3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms