Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms