Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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