Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms