Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC63Q8NA47 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms