Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6S4

ANKRD13C, Ankyrin repeat domain-containing protein 13C, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD13CQ8N6S4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD13CQ8N6S4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms