Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHCHD4Q8N4Q1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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