Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC103Q8IW40 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC103Q8IW40 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC103Q8IW40 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC103Q8IW40 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC103Q8IW40 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC103Q8IW40 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC103Q8IW40 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC103Q8IW40 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC103Q8IW40 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC103Q8IW40 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC103Q8IW40 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC103Q8IW40 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC103Q8IW40 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC103Q8IW40 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC103Q8IW40 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC103Q8IW40 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC103Q8IW40 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC103Q8IW40 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC103Q8IW40 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC103Q8IW40 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC103Q8IW40 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC103Q8IW40 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC103Q8IW40 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC103Q8IW40 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC103Q8IW40 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC103Q8IW40 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC103Q8IW40 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC103Q8IW40 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC103Q8IW40 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC103Q8IW40 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC103Q8IW40 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC103Q8IW40 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms