Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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