Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4L9

PPP1R42, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 42, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R42Q7Z4L9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPP1R42Q7Z4L9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms