Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms