Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
APTXQ7Z2E3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms