Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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C9orf47Q6ZRZ4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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C9orf47Q6ZRZ4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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C9orf47Q6ZRZ4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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C9orf47Q6ZRZ4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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C9orf47Q6ZRZ4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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C9orf47Q6ZRZ4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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C9orf47Q6ZRZ4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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C9orf47Q6ZRZ4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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C9orf47Q6ZRZ4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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C9orf47Q6ZRZ4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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C9orf47Q6ZRZ4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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C9orf47Q6ZRZ4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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