Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms