Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBLN3Q6UW01 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBLN3Q6UW01 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBLN3Q6UW01 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBLN3Q6UW01 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBLN3Q6UW01 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBLN3Q6UW01 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBLN3Q6UW01 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBLN3Q6UW01 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBLN3Q6UW01 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBLN3Q6UW01 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms