Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPPQ6IPU0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms