Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD40Q6AI12 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms