Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RNF20Q5VTR2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF20Q5VTR2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF20Q5VTR2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms