Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 LGR6-203ENST00000367278 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 GPT2-202ENST00000440783 4228 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms