Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PXDC1Q5TGL8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms