Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PERM1Q5SV97 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms