Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCID2Q5JVF3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms