Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITRM1Q5JRX3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms