Protein–RNA interactions for Protein: Q58FG1

HSP90AA4P, Putative heat shock protein HSP 90-alpha A4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AA4PQ58FG1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
HSP90AA4PQ58FG1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSP90AA4PQ58FG1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms