Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms