Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA8Q53HL2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms