Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CFAP100Q494V2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP100Q494V2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms