Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBPF8Q3BBV2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms