Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7S5

SMIM21, Small integral membrane protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM21Q3B7S5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM21Q3B7S5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms