Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms