Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
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