Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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RTL8BQ17RB0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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RTL8BQ17RB0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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RTL8BQ17RB0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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RTL8BQ17RB0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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RTL8BQ17RB0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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RTL8BQ17RB0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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RTL8BQ17RB0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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RTL8BQ17RB0 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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RTL8BQ17RB0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTL8BQ17RB0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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