Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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SGCAQ16586 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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SGCAQ16586 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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