Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NTRK3Q16288 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NTRK3Q16288 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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