Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC6Q16204 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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