Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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