Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
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TRIP13Q15645 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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TRIP13Q15645 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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TRIP13Q15645 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIP13Q15645 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms