Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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PTPRRQ15256 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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PTPRRQ15256 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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PTPRRQ15256 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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PTPRRQ15256 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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PTPRRQ15256 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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PTPRRQ15256 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRRQ15256 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
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PTPRRQ15256 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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PTPRRQ15256 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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PTPRRQ15256 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRRQ15256 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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