Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NECTIN1Q15223 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NECTIN1Q15223 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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