Protein–RNA interactions for Protein: Q15119

PDK2, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK2Q15119 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDK2Q15119 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDK2Q15119 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDK2Q15119 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDK2Q15119 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDK2Q15119 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDK2Q15119 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDK2Q15119 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PDK2Q15119 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDK2Q15119 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms