Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAM2Q15035 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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