Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAPTM4AQ15012 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAPTM4AQ15012 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms